Aproveitando o sucesso dos jogos Pokémon, em 1º de abril de 1997, no Japão, foi lançado o anime Pokémon. Com muitos elementos dos jogos Pokémon Green e Red, de 1996, o desenho conta a história de Ash Ketchum, que ao completar 10 anos de idade consegue seu primeiro Pokémon, Pikachu, e começa sua jornada, motivado pelo sonho de ser um Mestre Pokémon. No anime a batalha por turnos não é tão valorizada e um Pokémon pode evoluir no meio de um combate. Outra diferença é que Ash, mesmo chegando atrasado à entrega de Pokémons pelo professor Carvalho, conseguiu seu Pokémon inicial. Treinadores podem conseguir seu primeiro Pokémon nos Centros Pokémons, hospitais especializados em tratar essas criaturas; além disso no anime alguns Pokémons podem falar, como o Meowth da Equipe Rocket e o Gastly do Pico da Donzela.
Na trajetória de Ash ele precisa visitar várias cidades, vencendo desafios, outros treinadores e os líderes de ginásio. Obtendo as oito insígnias ao vencer os líderes de ginásio do continente em que está, Ash pode participar da liga Pokémon. Cada continente tem oito líderes de ginásio e uma liga Pokémon, com exceção do Arquipélago Laranja, que possui cinco líderes. Além deste, Ash já visitou Kanto, Johto, Hoenn e atualmente está em Sinnoh.
Em sua jornada Ash está sempre acompanhado de amigos, tais como a líder de ginásio de Pokémons aquáticos Misty, o aspirante a criador Pokémon Brock, o observador Pokémon Tracey, a coordenadora May, entre outros. Com a ajuda de seus amigos e de seus Pokémons, Ash também precisa lutar o tempo todo contra inimigos, principalmente contra Jessie e James da Equipe Rocket.
Quando os jogos foram recebidos bem pelas crianças americanas, o anime Pokémon foi dublado e lançado em 8 de Setembro de 1998 nos Estados Unidos. Com 11 anos em exibição, o anime já originou mais de 500 episódios, 11 filmes, 10 curta-metragens e 29 especiais, além de possuir um programa na TV apenas com esse assunto: o Pokémon Sunday. Com alguns elementos do anime, existe também o jogo Pokémon Yellow, no qual o treinador é seguido por um Pikachu o tempo todo. Apesar de não possuir a mesma audiência de antes, o anime ainda desperta várias críticas graves que o acusam de satanismo e de estimular crianças a ficarem mais competitivas, fazendo-as até a usar animais para brigar. O anime também é a principal mídia que motiva a criação de tantos produtos Pokémon.